南京建國醫院作為男性專科醫院，本質上是將綜合醫院的泌尿科分立出來，對病種細分并進行研究針對治療而成立的醫院。作為專科醫院，疾病類型的細分歸類更為精細。南京建國醫院醫生研究團十年不斷探索挖掘男性泌尿系統那些存在炎癥隱患的病癥，將醫學上不治的小病扼殺在其發展成重病之前。

　　2006年12月29日，江蘇省首例早泄手術在南京建國醫院實施，不僅給江蘇早泄患者帶來了福音，也填補了江蘇醫療界早泄手術治療的空白。（早泄病種添加）

　　2008年，我省例運用顯微外科進行精索靜脈曲張手術在南京建國醫院成功施行，為我院13000多名精索靜脈曲張康復患者奠定了基礎。（精索靜脈曲張病種添加）

<南京建國醫院十年感恩回饋月（11月）手術費補貼15%>

　　2013年，在成立十年之際的南京建國醫院，接診及挖掘病種數量大類已達到28類，規范病種53種，其中：

　　前列腺疾病包括：前列腺炎、前列腺增生、前列腺肥大、前列腺囊腫等9種；

　　泌尿生殖感染疾病包括：包皮龜頭炎、陰囊炎、睪丸炎、附睪炎、精囊炎等13種；

　　病毒感染包括：生殖器皰疹、尖銳濕疣、梅毒、淋病等8種；

　　生殖整形包括：包皮過長、包莖、陰莖延長、陰莖彎曲、尿道下裂、睪丸扭轉等8種；

　　性功能障礙包括：陽痿、早泄、性欲低下等7種；

　　男性不育包括：少精、死精、血精等5種。

<南京建國醫院十年感恩回饋月（11月）檢測費補貼30%、治療費補貼20%>

　　53種規范病種居全國泌尿科醫院之首，成為男科醫院中病種全的綜合醫院

　　據南京泌尿研究中心康復率調查數據顯示，隨著病種細分化的開展，男性泌尿疾病有效率總體水平上升至99.86%，綜合大病種的病例數逐漸分散到細分的小病種的數量之中，使更多患小病卻無從醫治的患者帶來歸屬感。

　　自2006年開始，病種覆蓋的方方面面化，有效率的顯著提高，隨著南京建國醫院被劃入勞動社會保障局指定的醫療保險定點機構名單內后，南京建國醫院就診人數不斷遞增，2013年醫保報銷總金額高達1163.7萬元。